Ехоенцефалографію призначають як дорослим, так і дітям при наявності таких симптомів і скарг:
- підозра на струс мозку внаслідок травм голови,
- напади нудоти, не пов'язані з прийомом їжі,
- запаморочення і відчуття шуму у вухах,
- погіршення пам'яті та працездатності, дефіцит уваги,
- втрата свідомості та порушення координації рухів,
- відчуття нестачі повітря,
- порушення сну і частий біль голови,,
- невротичні реакції, такі як тики, енурез, заїкання тощо.
Найчастіше ехоенцефалографія застосовується як метод попередньої діагностики перед проведенням магнітно-резонансної (МРТ) або комп'ютерної (КТ) томографії головного мозку. У деяких випадках Ехо-ЕГ може повністю замінити ці методи, наприклад, через наявність протипоказань або через важкий стан обстежуваного.